文献管理软件主要分为两大类
目前的文献管理软件主要分为两大类，一种是常见的单机版，或者叫做桌面版，另外一种就是在线版。它们一般能通过因特网直接连接某些数据库，并从数据库中将数据下载到本地并建立数据库，可以自动剔除不同来源的重复资料。泛普软件的文献管理软件可以非常方便地帮你管理全文，可以在软件中做笔记，并对笔记进行管理等等。
传统的单机版的主要功能为：
一、帮助我们管理数目繁多的文献资料;
二、撰写各种论文时，用该软件来自动编排参考文献格式，无需手动修改;即使改投其它杂志，只需简单转换，无需逐一校对。
相比单机版，在线版的主要有以下优势：
同样帮助我们管理数目繁多的文献资料，但是具有更多的灵活性。
文献管理软件实现文献的资源共享，方便地得到精选的文献资料。
互动的文献管理，即文献读者之间的交流成为可能，实现了以文会友的目的。
借助在线文献管理，有利于形成相关学科领域的学术圈子。
在线文献管理可以成为专家学者展示自己成果，宣传自己的理论的有效平台。
文献资料完全保存于互联网上，只要能上网，就可以管理文献，便携性提高到了极致。
参考文献管理软件完全免费
但是在线文献管理也有一些劣势，比如在撰写论文是自动插入并编排文献到word等文本编辑软件的时候，在线文献管理还无法直接实现这一功能。需要通过导出文献到endnote等单机版软件后方能实现。
尽管如此，随着互联网技术的不断发展，用在线文献管理来实现撰写辅助的功能也已经有了一定的进展，并且将发展地越来越完善。所以，在线文献管理完全替代现有单机版软件，或成为主流，都将在不久的将来发生。
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